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Thèse

Effets de la bioturbation sur la diversité des communautés bactériennes du sédiment. Approches expérimentale et in-situ. De Melinna palmata aux communautés de la vasière Ouest-Gironde

Soutenue

le 15-12-2014

Par

Cécile MASSÉ

Directeur(s) de thèse

Aurélie Ciutat / Frédéric Garabétian

Membres du jury

Guy BACHELET, directeur de recherche CNRS, UMR EPOC, examinateur
Franck GILBERT, directeur de recherche CNRS, UMR EcoLab (Toulouse), rapporteur
Artur ALVES, Principal researcher, Université d'Aveiro (Portugal), rapporteur
Francis ORVAIN, maître de conférences HDR, université de Caen, FRE BioMEA, rapporteur
Aurélie CIUTAT, chargée de recherche CNRS, UMR EPOC, co-directrice de thèse
Frédéric GARABETIAN, professeur, université de Bordeaux, UMR EPOC, co-directeur de thèse

Résumé

Le lien entre la macrofaune et les communautés bactériennes benthiques a été déterminé selon deux approches : (1) une approche expérimentale à l'échelle de l'individu ciblée sur les effets de l'activité et de la bioturbation du polychète déposivore de surface Melinna palmata sur la distribution des communautés bactériennes des premiers millimètres de l'interface eau-sédiment ; (2) une approche in-situ à l'échelle de la communauté de mise en corrélation des patrons spatiaux de distribution des communautés de macrofaune et de bactéries.
Melinna palmata appartient à un nouveau groupe fonctionnel de bioturbation décrit pour la première fois, convoyeur de surface. L'utilisation de ce nouveau modèle biologique a permis de mettre en évidence que les activités de prospection et d'égestions modifient significativement la distribution des communautés bactériennes de la couche oxique de l'interface eau-sédiment. Ce lien est à la fois influencé par l'apport de matière organique de différentes qualités, et impacte la consommation et la minéralisation de cette matière organique.
Le lien entre les patrons spatiaux de distribution des communautés de macrofaune et de bactéries a été étudié en in-situ, dans la vasière Ouest-Gironde. Les deux compartiments ont évolués le long d'un gradient avéré de teneur en matière organique et de taille des particules dans cette vasière. La corrélation des matrices biologiques n'a cependant pas été statistiquement significative et nécessite d'être approfondi.

Mots-clé

interface eau-sédiment, activité, bioturbation, composition des communautés bactériennes

Mémoire en ligne

http://www.theses.fr/2014BORD0039/document