Thèse
Approche intégrée des conditions physico-chimiques affectant les cortèges biologiques de la partie fluviale de l'estuaire de la Gironde
Soutenue
le 04-02-2015Par
François DINDINAUDDirecteur(s) de thèse
Benoit Sautour / Guy Bachelet
Membres du jury
Mme TACKX Micky, Professeur, Univ. de Toulouse, Rapporteur
M. DAUVIN Jean Claude, Professeur, Univ. de Caen, Rapporteur
M. LUCZAK Christophe, Maître de Conférences, Univ. d'Artois, Rapporteur
M. GARABETIAN Frédéric, Professeur, Univ.de Bordeaux, Examinateur
M. ETCHEBER Henry, Chargé de Recherche CNRS, Univ. de Bordeaux, Invité
M. LITRICO Xavier, Directeur Lyonnaise R&D, LyRE, Invité
M. SAUTOUR Benoit, Professeur Univ. de Bordeaux, Directeur
M. BACHELET Guy, Directeur de Recherche CNRS, Univ. de Bordeaux, Co-Directeur
Résumé
Les estuaires, situés à l'interface entre les domaines continental et marin, constituent des zones essentielles dans les échanges de matières. Ils jouent dès lors un rôle capital pour les cycles biogéochimiques et biologiques et subissent, par ailleurs, des pressions climatiques et anthropiques croissantes depuis plusieurs décennies. Le présent travail a été focalisé sur les peuplements benthiques et pélagiques présents dans la partie fluviale (Garonne et Dordogne) de l'estuaire de la Gironde, zone à très faible salinité où ces peuplements n'avaient encore jamais été étudiés. Alors que la méiofaune, composée principalement de Nématodes, s'est avérée relativement abondante dans les domaines intertidal et subtidal, le macrobenthos est apparu composé essentiellement d'Oligochètes en intertidal et complètement absent en subtidal. La grande plasticité du copépode dominant
Eurytemora affinis a été confirmée, celui-ci occupant une niche écologique différente dans la partie fluviale de l'estuaire par rapport à la zone haline. L'importance de la température plutôt que la qualité du pool nutritif sur la productivité d'
E. affinis a été démontrée, mettant en évidence une fois de plus la grande adaptabilité de cette espèce dans un habitat très fluctuant. L'étude de l'habitat benthique et pélagique, notamment en termes de qualité du pool nutritif disponible pour les organismes, a démontré que la contribution de la matière organique réfractaire d'origine terrestre est dominante. La contribution du microphytobenthos à la composition de la matière organique sédimentaire et pélagique a aussi été mise en évidence. Enfin, l'étude des communautés planctoniques dans la partie fluviale de l'estuaire de la Gironde a montré que l'espèce
E. affinis y occupe une position clef.
Mots-clé
estuaire fluvial de la Gironde, communautés benthiques et pélagiques,
Eurytemora affinis, pool nutritif, variabilité environnementale
Mémoire en ligne
http://www.theses.fr/2015BORD0010/document