UMR CNRS 5805 EPOC
Environnements et Paléoenvironnements
Océaniques et Continentaux

        

Consignes de Sécurité et Numéros d'Urgence
(à l'usage des personnels du laboratoire)

March 25, 2022

Anais RICHARD

Xavier de Montaudouin / Olivier Maire

Mme DUPUY Christine, Professeure, Université de La Rochelle, Rapporteure
M. DENIS Lionel, Professeur, Université de Lille, Rapporteur
Mme MICHAUD Emma, Chargée de recherche HDR, CNRS, Examinatrice
M. MERMILLOD-BLONDIN Florian, Directeur de recherche HDR, CNRS, Examinateur
M. BOLLACHE Loïc, Professeur, Université de Bourgogne-Franche Comté, Examinateur
M. de MONTAUDOUIN Xavier, Professeur, Université de Bordeaux, Directeur de thèse
M. MAIRE Olivier, Maître de conférences, Université de Bordeaux, Co-encadrant
M. ORVAIN Francis, Maître de conférences HDR, Université de Caen, Invité

Au sein des écosystèmes intertidaux côtiers, le microphytobenthos (MPB) est l'un des principaux producteurs primaires, et représente donc une source de carbone importante pour la faune benthique. Des facteurs environnementaux tels que la lumière, la température, la concentration en nutriments dans les sédiments, et le broutage par la faune benthique sont connus pour contrôler la dynamique du MPB. En revanche, l'influence de la bioturbation de la macrofaune, incluant le remaniement sédimentaire (i.e., transport des particules de sédiment) et la bioirrigation (i.e., transport de l'eau interstitielle et des composés dissous), sur l'activité du MPB reste encore peu étudiée. L'objectif de ce travail de thèse consistait donc à réaliser des expériences en laboratoire permettant de quantifier simultanément (1) l'activité de bioturbation de trois espèces dominantes de la macrofaune benthique intertidale (Hediste diversicolor, Scrobicularia plana et Cerastoderma edule), (2) les flux d'oxygène et de nutriments (ammonium, nitrate, nitrite, phosphate et silice) à l'interface eau-sédiment, et (3) la biomasse et l'activité photosynthétique du MPB. L'éventuelle modulation des interactions par les traits fonctionnels des bioturbateurs, le type de sédiment, l'infection parasitaire, et la densité des organismes a été prise en compte. Nos résultats ont montré que l'influence de la macrofaune sur la biomasse et l'activité photosynthétique du MPB dépend largement du mode et de l'intensité de bioturbation. Ainsi, le biodiffuseur de surface S. plana génère un fort remaniement sédimentaire dû à une intense activité siphonale lors des périodes de nutrition. Par conséquent, la biomasse de MPB a été réduite, malgré une légère stimulation des flux de nutriments. En revanche, le diffuseur à galeries H. diversicolor augmente fortement la disponibilité des nutriments par son intense activité de bioirrigation, ce qui compense l'effet négatif de la pression de broutage et de la perturbation sédimentaire de surface. Ainsi, aucun effet significatif global net sur la dynamique du MPB n'a été détecté. L'impact du biodiffuseur de surface C. edule sur la biomasse du MPB dépend de son environnement sédimentaire. En effet, le remaniement sédimentaire généré par la coque, principalement dû à ses activités de fouissage et de locomotion, est plus élevé en milieu cohésif qu'en milieu non-cohésif. Par conséquent, l'impact sur la biomasse de MPB en milieu cohésif est négatif, malgré une faible stimulation des flux de nutriments. En revanche, aucun effet n'a été détecté en milieux non-cohésif. Concernant les autres facteurs environnementaux, le macroparasite Himasthla elongata, infectant la coque au stade métacercaire, ne modifie pas son activité de bioturbation, ni son impact sur la dynamique biogéochimique sédimentaire, du moins chez de jeunes hôtes. D'autre part, la relation entre la biomasse du MPB et la densité des organismes n'est pas toujours linéaire. La compétition intraspécifique peut modifier les activités de nutrition et de bioturbation des individus, avec des effets contrastés sur le MPB. Finalement, cette thèse souligne que l'impact de l'activité de la macrofaune sur la dynamique du MPB résulte d'une balance entre facteurs stimulants et inhibants, et que cet effet est modulé par des facteurs biotiques et abiotiques. Ces expériences mettent en avant l'importance de la bioturbation de la macrofaune benthique dans le fonctionnement des écosystèmes intertidaux côtiers et estuariens.

Ecosystème littoral, Bioturbation, Biogéochimie, Microphytobenthos, Parasitisme