2006-2009 : projet ANR MULTISTRESS (BLAN06-3_134452) : Sensibilité et réponse adaptative des bivalves soumis à un stress multiple : infestation parasitaire, charge bactérienne et pollution métallique. Coordinateur : X. de Montaudouin.
2006-2009 : programme EC2CO : Caractérisation fonctionnelle des biofilms microbiens du continuum « Barrage de Petit-Saut - fleuve Sinnamary » (Guyane Française) : activités vis-à-vis du mercure et du méthane. Coordinateur : Frédéric Jorand.
2006-2009 : projet Régional : Qualité des espaces littoraux en Aquitaine et Pays Basque espagnol : flux de contaminants et évolution du trait de côte, dans le cadre du Réseau de Recherche Littoral Aquitain. Coordinateur : P. Maron.
2006-2009 ANR SEST Effets du mercure sur la santé des écosystèmes aquatiques et des populations humaines ». Coordinateur : JP Bourdineaud
2007-2009 Projet de coopération Aquitaine - Québec : Développement d'une puce à ADN (cDNA microarray) afin de détecter le stress métallique et de révéler les mécanismes de toxicité générés par les métaux chez la perchaude (Perca flavescens) par une approche écophysiologique. Transfert et application de cette technologie à une espèce emblématique de la Région Aquitaine : l'anguille européenne (Anguilla anguilla). Coordinateurs P. Campbell et M. Baudrimont.
2007-2009 EC2CO-Cytrix : Effets d'une exposition précoce d'embryons de poissons aux polluants organiques persistants et conséquences sur la population. Projet GénérationPOP. Coordinateur : X. Cousin
2007-2010 ANR SEST : Caractérisation des transporteurs actifs impliqués dans la détoxication du cadmium chez les eucaryotes supérieurs. Coordinateur : Cyril Forestier.
2007-2010 ANR VMC : « Eco-toxicological and Economical Liability of eel exposed to Seasonal and global Change-induced O2-depletion and Pollution in Estuaries” (EELSCOPE). Coordinateur: Jörg Schäfer.
2007-2010 Programme EC2CO Cytrix ‘VOTR-TRAM' : (Cycles hydro-biogéochimiques, transferts et impacts écotoxicologiques): Rôle des VOies TRophiques sur le TRAnsferts de polluants Métalliques en zone côtière ostréicole. Coordinateur : G. Blanc.
2007-2009 : Projet de coopération Aquitaine - Québec : Développement d'une puce à ADN (cDNA microarray) afin de détecter le stress métallique et de révéler les mécanismes de toxicité générés par les métaux chez la perchaude (Perca flavescens) par une approche écophysiologique. Transfert et application de cette technologie à une espèce emblématique de la Région Aquitaine : l'anguille européenne (Anguilla anguilla). Coordinateurs : M. Baudrimont et P. Campbell.
2007-2009 : projet EC2CO : L'étude du fractionnement isotopique du mercure dans les principaux compartiments d'un hydrosystème peut-elle répondre au traçage des sources d'origines naturelle et anthropique de cet élément ? Coordinatrice : Laurence Maurice Bourguoin.
2007-2009 : programme EC2CO (CODEPOM) : Contamination des écosystèmes polaires par le mercure. Coordinateur : Christophe Ferrari.
2007-2010 : projet ANR VMC (Vulnérabilité, Milieux et Climats) EEL-scope : Eco-toxicological and Economical Liability of eel exposed to Seasonal and global Change-induced O2-depletion and Pollution in Estuaries. Coordinateur : J. Schäfer.
2008-2009 : projet EC2CO Cytrix (Cycles hydro-biogéochimiques, transferts et impacts écotoxicologiques) : Etude pluridisciplinaire de l'impact de la remédiation d'un site industriel pollué par les métaux (Cd, Zn) sur la dynamique de restauration d'état écologique des hydrosystèmes continentaux - Résilience et capacités de récupération des écosystèmes. Coordinatrice : M. Baudrimont.
2008-2010 : programme CECALM : Contamination des écosystèmes alpins par le mercure. Coordinateur : Christophe Ferrari.
2008-2010 : projet Régional : Apports scientifiques face à la problématique conchylicole du Bassin d'Arcachon. Coordinateur : B. Sautour.
2008-2012 ANR CESA RE-SYST . Récupération d'un SYSTème fluvial pollué par les métaux (Cd, Zn) après remédiation d'un site industriel. Coordinatrice: A. Feurtet-Mazel.
2008-2009 Projet EC2CO Cytrix : Etude pluridisciplinaire de l'impact de la remédiation d'un site industriel pollué par les métaux (Cd, Zn) sur la dynamique de restauration d'état écologique des hydrosystèmes continentaux - Résilience et capacités de récupération des écosystèmes. Coordinatrice : M. Baudrimont.
2008-2011 AFSSA : Investigation de la situation de toxicité observée dans les coquillages du bassin d'Arcachon. Coordinateur : R. Bire
2009-2011 : projet ANR CES (Contaminants, Ecosystèmes et Santé) RE-SYST : REcupération d'un SYSTème fluvial pollué par les métaux (Cd, Zn) après remédiation d'un site industriel. Coordinatrice : A. Feurtet-Mazel.
2009-2011 ANR PRECOD :: Echantillonneurs passifs pour la MEsure des Substances chimiques et de la TOXicité associée dans l'eau et les effluents industriels. Projet Emestox. Coordinatrice : H. Budsinski
2010-2011 Projet Cytrix EC2CO,: Perturbation des rythmes biologiques de l'huître Crassostrea gigas par les efflorescences d'algues toxiques. Approches écotoxicologiques et éthologiques. Coordinateur D. Tran
2010-2011 Projet EC2CO Cytrix : Réponse biologique des civelles d'anguille européenne (Anguilla anguilla) à une exposition au méthylmercure. Approches in situ et expérimentale. Coordinatrice : V. Bolliet.
2010-2011 Projet International avec le Research Council de Norvège (Svalbard Science Forum Strategic funds),. Remote biosensor technology measuring valve gap and shell growth of bivalves for detecting accidental discharges in the Norwegian Arctic. Responsable français: JC Massabuau
2010-2012 Programme Européen PORTONOVO : Present and future of port water quality management in the EU Atlantic Area, Atlantic Area Programm
2010-2012 Projet EC2CO « Les microorganismes sulfato-réducteurs colonisant les racines de macrophytes aquatiques : Diversité et Risques liés à la méthylation du Hg et son transfert vers la Chaîne Trophique (DIRECT) »
2010-2012 Projet LITEAU 3 REPAMEP : REponse des PAlourdes aux stress environnementaux combinant Métaux, Efflorescences toxiques et Pathogènes. Coordinateur : X. de Montaudouin.
2010-2012 ANR CES : Contamination et Physiologie des Poissons exposés à des Polluants. Projet ConphyPop. Coordinateur : X. Cousin
2010-2013 ANR CESA RIPOST : Réponse Interdisciplinaire au Problème Ostréicole du bassin d'arcachon: approches in situ et expérimentales. Coordinateur : P. Gonzalez
2010-2014 Programme TRO-NANO (ANSES ;) : Etude du transfert trophique de nanomatériaux et des conséquences sur les organismes. Coordinatrice : J. Garric.
2011-2012 Projet International avec le Research Council de Norvège, RFFNORD,. “Remote Online Biosensors: Detection of Climate Change and Industrial Impact on Bivalve growth & behaviour in the Arctic ‘Talking Clams'”. Responsable français: JC Massabuau
2011-2012 Projet STATOIL, Norvège. Remote sensor biotechnology in Arctic. Establishment of a sensor system in the Kongsfjorden, Arctic. Responsable français: JC Massabuau
2011-2013 ANR ECOTECH : Outils innovants d'échantillonnage, d'analyses chimiques et biologiques pour le suivi de traitements avancés des eaux usées et des boues. Projet Echibioteb. Coordinatrice C. Miège
2011-2013 ANSES-ADEME : Les médicaments psychotropes en milieu aquatique, quels effets sur les écosystèmes aquatiques ? Quelles implications au niveau sociétal. Projet Psycheau. Coordinatrice : F. Geret
2011-2014 ANR CESA RIMNES : « Les Rapports Isotopiques du Mercure et les biomarqueurs NOTCH/apoptose : de nouveaux outils à l'interface Environnement - Santé ». Coordinateur L. Maurice.
2011-2014 ANR internationale Immorteel : Impacts des contaminations métalliques et organiques des systèmes de la Gironde et du St Laurent sur deux espèces en déclin, l'anguille européenne et américaine, conjointement financé par l'ANR et le CRSNG (Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie du Canada). Coordinatrice M. Baudrimont.
2011-2014 Programme DIREN/Parc Amazonien de Guyane « Etude des Petites Masses d'Eaux (PME) en Guyane et mise en place d'indices de qualité des eaux », . Coordinateur : R. Vigouroux (Bureau d'études en Environnement HYDRECO).
2011-2014 Programme Industriel Franco-Russe Characterization of an industrial impact of oil and gas industry in the Russian Arctic based on the online recording of molluscan bivalve behavior. Financement TOTAL. Principal Investigator: JC Massabuau
2011-2014 ADEME : Evaluation de la toxicité des APR Région Aquitaine s d'installation de stockage de déchets non dangereux et identification des agents chimiques responsables. Projet Toxlix. Coordinateur : L. Mazéas
2012-2015 ANR CESA PoToMAC « Potentiel Toxique dans les Milieux Aquatiques Continentaux» (). Coordinateur : N. Mazzella.
2012-2013 Etude pour l'ARS (Agence Régionale de Santé) de Guyane : synthèse des niveaux de contaminations en mercure dans les rivières Guyanaises.
2012-2014 Projet Aquitaine-Euskadi (France - Espagne) : « Application de méthodes complémentaires pour établir la concentration labile de métaux et de leurs effets biologiques dans des eaux estuariennes et portuaires». Coordinatrices M. Jesus Belzunce (AZTI) et M. Baudrimont.
2012-2015 ANR Internationale II France-Taiwan - Twin Rivers : « Pour une gestion intégrée et durable des ressources en eau de bassins soumis à des pollutions industrielles et urbaines: étude comparative du Lot (France) et du Danshuei (Taiwan)». Collaboration France-Taiwan (Agence de coopération : National Agence Council). Coordinatrice : A. Coynel.
2013-2016 Programme Européen DEVOTES, DEVelopment Of innovative Tools for understanding marine biodiversity and assessing good Environmental Status. 16 pays
2013-2017 ANR « Biogéochimie du mercure : relations entre spéciation, bioaccumulation et écotoxicité » . Resp EPOC JP Bourdineaud
2013 Projet Europeen ASSEMBLE GIGASCLOCK. Etude in situ de l'expression des gènes circadiens en conditions tidales en antiphase. Ecosse. Coordinateur D. Tran
2013-2015 Programme Industriel Franco-Russe, Characterization of an industrial impact of oil and gas industry in the Russian Arctic based on the online recording of molluscan bivalve behavior. Amendment n° 1. Financement TOTAL. Principal Investigator: JC Massabuau
2013-2016 ANR CESA STURTOP ; « Vulnérabilité et adaptabilité de la dernière population d'esturgeon européen (Acipenser sturio) aux facteurs de stress environnementaux : température, oxygène, polluants ». Coordinateur : J. Cachot.
2013-2017 ANR ACCUTOX. De la caractérisation des déterminants de l'accumulation des toxines paralysantes (PST) chez l'huître (C. gigas) au risque sanitaire dans son contexte societal. Responsable d'axe.
2013-2018 Programme USTH NUCOWS “Nutrient cycles and Contaminants in WaterS in Southeast Asia”. Coordinateur: Didier Orange.
2014-2020 Projet Européen Life +: Life + Nature, LIFE13 NAT/FR/00056. 2014-2020 : Préservation de Margaritifera margaritifera et restauration de la continuité écologique de la Haute Dronne. Co-coordinatrice : M. Baudrimont.
2014 Contrat Industriel avec TOTAL. Validation de la valvométrie HFNI aux Rivières Pilotes en présence d'une huile brute. PI : JC Massabuau
2014 PEPS « EXOMOD »,. Nouveaux modèles : la biodiversité pour explorer de nouveaux mécanismes biologiques et biochimiques. Coordinatrice Florence Correllou, Participant D. Tran
2016-2019 JPI OCEANS EPHEMARE : Ecotoxicological effects of microplastics in marine ecosystems. Coordinateur : Ricardo Beiras. Participants : J. Cachot, B. Morin, C. Clérandeau, F. Le Bihanic
2016-2020 ANR Jeune chercheur TRACE : TRansgenerational ACtions of pollutant in fish: implications of Epigenetics in ecotoxicology. Coordinateur : Fabien Pierron
2017 Odyssée Race for Water : Pollution des océans par les microplastqiues. Participants : J. Cachot, B. Morin, C. Clérandeau
2017-2020 GIP Seine-Aval Plastic-Seine : Flux et impacts des microplastiques dans l'estuaire de la Seine. Coordinateur : J. Cachot, J. Gasperi
2019 Expédition TARA : Aux origines de la pollution plastique. Coordinateur : JF Goglione. Participants : J. Cachot, B. Morin, C. Clérandeau
2020-2022 JPI OCEANS RESPONSE : Toward a risk-based assessment of microplastic pollution in marine ecosystems. Coordinateur : F. Regoli. Participants : J. Cachot, B. Morin, C. Clérandeau

2006-2009 Projet Régional () : Qualité des espaces littoraux en Aquitaine et Pays Basque espagnol : flux de contaminants et évolution du trait de côte, dans le cadre du Réseau de Recherche Littoral Aquitain. Coordinateur : Pr P. Maron.
2008-2011 GIP Seine-Aval : Analyse de la toxicité globale et identification des composés toxiques à risque dans l'estuaire de Seine. Projet ToxSeine. Coordinateur : J. Cachot
2008-2011 GIP Seine-Aval : Colonisation et utilisation des habitats estuariens par les poissons migrateurs thalassotoques : approche comparative Seine-Gironde. Projet Thalassotoque. Coordinateur : E. Rochard
2008-2011 Région Aquitaine, Université Bordeaux 1 :: Analyse de la toxicité et identification des polluants chimiques à risque dans le compartiment sédimentaire de divers écosystèmes aquatiques aquitains. Projet AquiTox. Coordinateur : J. Cachot
2008-2010 Programme régional ASCOBAR: « Apports scientifiques face à la problématique conchylicole du Bassin d'Arcachon ». Le projet global est piloté par B. Sautour. Participation au Volet 2 "Apports Anthropiques" coordonné par H. Budzinski et P. Anschutz.
2008-2011 Projet Région Alpes (): « Contamination des écosystèmes Alpins par le mercure »
2010-2012 GIP Seine Aval : Cartographie du danger génotoxique au niveau du bas estuaire et étude de transfert des contaminants du milieu vers les orgnaismes. Projet BCG. Coordinateur : J. Couteau
2010-2014 Projet ETIAGE: Etude intégrée de l'effet des apports amont et locaux sur le fonctionnement de la Garonne estuarienne. Coordinateurs : H. Etcheber et P. Gonthier.
2010-2013 Programme Régional OSQUAR : « Ostréiculture et qualité du milieu Approche dynamique du bassin d'Arcachon». Le projet global est piloté par B. Sautour. Participation au Volet 2 "Usages et Qualité sur un territoire ostréicole" coordonné par H. Budzinski et J. Dacchary-Bernard.
2010-2013 Projet interrégional Aquitaine/Midi Pyrénées MEDIC'EAU: Source, circuit, impacts et gouvernance des risques sanitaires et environnementaux des résidus médicamenteux des zones urbaines : Bordeaux / Montréal /Toulouse. Coordinatrices : H. Budzinski et M. Gerino.
2010-2013 Projet interrégional Aquitaine/Midi Pyrénées MICANG : Développement d'une puce à ADN pour la caractérisation de l'état de santé des anguilles européennes et américaines (Anguilla anguilla et Anguilla rostrata) des systèmes « Gironde Garonne Dordogne » et St Laurent. Coordinatrice : M. Baudrimont.
2010-2014 Programme interrégional Aquitaine & Midi Pyrénées « L'étude du fractionnement isotopique du Hg dans les principaux compartiments de deux bassins versants Guyanais ainsi que dans les cheveux des populations exposées peut-elle répondre au traçage des sources d'origine naturelle et anthropique du Hg? »
2011-2014 APR Région Aquitaine :: Etude de la vulnérabilité et de l'adaptabilité des populations d'esturgeon du St Laurent (Acipenser oxyrinchus) et de la Gironde (Acipenser sturio) dans le contexte de la pollution des milieux et du changement climatique. Projet SturTOP. Coordinateur : J. Cachot
2011-2014 Collaboration avec Ifremer Argenton : Caractérisations des pontes de l'huître Crassostrea gigas dans le bassin d'Arcachon et à Marenne-Olerons. Collaboration dans le cadre de la thèse d'Ismael Bernard (2011) dirigé par S. Pouvreau. 1 papier rédigé à soumettre
2011-2014 PIREN-Seine : Phase 6,: axe Ecologie Ecotoxicologie Coordinateur : J.M. Mouchel
2012-2015 Collaboration avec l'INRIA Lilles, Equipe Non-A. Modélisation mathématique du rythme circadien et circatidal de l'huitre Grassostrea gigas. Collaboration avec D. Effimov et R. Ushibora
2012-2013 Projet innovant UMR EPOC : Implication de mécanismes épigénétiques dans les effets à long terme de la pollution chez les organismes aquatiques ?, financé par l'UMR EPOC. Coordinateur : Fabien Pierron.
2012-2014 Programme Marais du Nord Médoc : Potentialités de développement d'une activité ostréicole dans les Marais du Nord-Médoc - Protocole expérimental visant à tester la faisabilité de l'affinage d'huîtres en Marais. Projet financé par la CDC Pointe du Médoc, CG 33, Région Aquitaine, Port autonome de Bordeaux, SRC, professionnels, SMIDDEST. Coordinatrice M. Baudrimont.
2012-2015 Programme Régional OSQUAR2- volet 2 : impacts environnementaux croisés sur l'huitre et la zostère. Co-responsable de la partie « zostères - écotoxicologie expérimentale du projet ». Coordinateur : P. Gonzalez.
2012-2015 Projet HY12FRA: Pression de sélection des barrages aquatiques sur la migration des civelles Projet, financé par EDF. Coordinateurs : De Oliveira E, Pierron F., Daverat F.
2012 Collaboration avec la station Marine de Wimereux et LMBA/UMR 6205 CNRS - Universités de Bretagne Occidentale et Bretagne Sud : Analyse mathématique du signal de l'activité valvaire par la technique des shot noises. Collaboration avec F. Schmidt et G. Durrieu
2013-2016 Convention AEAG (Agence de l'Eau Adour Garonne) :: Impact des polluants et du changement climatique sur les capacités de reproduction et de développement embryo-larvaire de l'huître creuse Crassostrea gigas dans le Bassin d'Arcachon. Coordinateurs : P. Gonzalez, B. Morin
2013 /2016 Convention SIBA (Syndicat Intercommunal du Bassin d'Arcachon) :: Impact des polluants et du changement climatique sur les capacités de reproduction et de développement embryo-larvaire de l'huître creuse Crassostrea gigas dans le Bassin d'Arcachon. Coordinateurs : P. Gonzalez, B. Morin
2013-2014 Projet innovant UMR EPOC. A la recherche de l'horloge moléculaire à l'origine du rythme tidal chez les huitres. Damien Tran
Programme GAGILAU : Quels fleuves et estuaires pour demain, Garonne-Gironde / Saint Laurent. Coordinateurs : G. Blanc et D. Salles.
2017-2020 Convention SIBA (Syndicat Intercommunal du Bassin d'Arcachon) : Pesticides émergents et leurs mélanges. Quels risques pour les organismes non cibles ? Approches en laboratoire et in situ. Coordinateurs : P. Gonzalez, B. Morin
2018-2021 APR Région Bretagne MOULOBS : Etude d'opportunité pour un Suivi de populations d'Invertébrés marins en tant que sentinelles de la qualité des eaux dans la zone de dragages du chantier du nouveau Port de Brest. Coordinateur : M. Auffret. Participants : B. Morin, C. Clérandeau, J. Cachot
2019-2021 APR Nouvelle Aquitaine ARPLASTIC : Etude de la contamination par les microplastiques de l'écosystème et des produits de la mer dans le Bassin d'Arcachon. Première étude du risque sanitaire. Coordinatrice : B. Morin.