Alicia Romero-Ramirez
Antoine Grémare
Jean-Claude Duchêne

L'utilisation d'images de profil sédimentaire (SPI) comme outil d'évaluation d'impact sur les habitats benthiques dans des programmes de surveillance environementale est devenu une approche rentable qui permet un échantillonnage plus intensif que les analyses de faune benthique [1]. Cependant, l'analyse de SPI peut conduire à des résultats subjectifs lorsque différentes méthodes de traitement d'images sont utilisées. Pour améliorer cette faiblesse, un logiciel a été développé pour l'analyse de SPI : SpiArcBase.
SpiArcBase permet de dessiner automatiquement l'interface eau-sédiment ainsi que la couche apparemment oxydée (apparent Redox Potential Discontinuity ou aRPD) qui est indicative de la transition entre surface oxydée et sédiments profonds réduits. SpiArcBase permet aussi d'isoler semi-automatiquement des structures biogéniques et de les traiter séparément pour extraire des informations concernant leur nature, leur taille et leur profondeur. Ces informations peuvent être exportées comme fichier .txt et/ou utilisées pour calculer des indices de qualité d'habitat benthique. Le logiciel utilise une base de données pour sauvegarder les images et les information extraites.
L'objectif principal de SpiArcBase est de devenir l'outil standard pour l'analyse de SPIs.

Figure 1 : Exemple d'image de profil sédimentaitre (SPI) (à gauche) et les différents résultats (au centre et à droite) après l'analyse avec SpiArcBase.

[1] Rossenberg, Magnusson and Nilsson (2009) Marine Pollution Bulletin, Volume 58(4), 565-572.

Pour en savoir plus sur le logiciel et le télécharger, consultez le site :
http://spiarcbase.epoc.u-bordeaux1.fr/